Nikon Z6 III được trang bị bộ xử lý EXPEED 7, tương tự như trong các mẫu máy cao cấp Z8 và Z9. Bộ xử lý này nhanh hơn khoảng 10 lần so với Z6 II, kết hợp với cảm biến Partially-Stacked để cung cấp tốc độ lấy nét tự động ấn tượng, tốc độ chụp liên tục cao