Hệ vi sinh vật đường ruột là một cộng đồng phức tạp các vi sinh vật sống trong các đoạn khác nhau của ống tiêu hóa, chúng có khoảng một trăm ngàn tỷ, gấp 10 lần số tế bào của cơ thể với khoảng 300-1000 loài, có trọng lượng ước khoảng 1,0-1,5 kg. Trong các vi khuẩn đường ruột, có 85% là các vi khuẩn có lợi, chúng có vai